Linux Performance Tuning and Stabilization Tips (by Yoshinori Matsunobu) - много интересного, от примеров tuning & debugging до производительности на SAS harddrive vs. SSD vs Fusion.
Еще статья про Linux I/O scheduler queue size and MyISAM performance (http://planet.mysql.com/entry?id=19017)
Пошел менять scheduler и тестировать.
Update:
попробовал на слабой тестовой машине - изменение scheduler на deadline дало около 2% скорости, а вот увеличене I/O scheduler queue size даже ухудшило скорость. надо будет проверить на "настоящем" сервере.